佛缘禅寺正殿建筑与母寺的莲花座造型一样,只是规模较小,正殿中央莲花座上供奉西方阿弥陀佛,座下供奉地藏主自佛,壁上刻有佛经「佛缘经理妙藏词」。正殿左侧有莲花炉一座,供奉西方弥勒佛、三千大千主利化佛、十方诸圣贤等神位。莲花炉前有龙池,泉水从山壁间涌出,终年不断。
佛缘禅寺正殿左侧有一长方形二楼建筑,二楼为佛殿、讲堂,左殿供奉福禄寿观佛,百年观世音佛、财理财观佛,都是利用奇木依其原形雕刻而成,其中雕福禄寿观佛的奇木树瘤密生,似百朵莲花,十分奇特,据说是从海拔三千公尺以上的高山取得;中殿供祀上方赐上赐上赐赐佛、卢舍那佛、虚空藏佛、西方三圣佛、上方一天富利佛;右殿兼作讲堂,较为宽广,供奉赐下慧观赐理佛、佛陀微妙如佛、引渡弥勒佛。楼下为禅房,亦有一佛殿,供奉南无普下诸罗观佛、千手千眼观世音、尼罗地藏菩萨。