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深坑鎮南宮位於深坑區大崙腳，深坑的舊名「簪纓」，因為四面環山，形成坑狀而有此名。深坑鎮南宮主祀神祇是一塊經過風化後形狀像媽祖的巨石，該石像也有百年歷史，四周圍的牆都是用方形狀的石塊堆砌而成，石媽祖已成為深坑區最具有特色的廟宇。

據說百年前有一個看牛的孩童，跑到一座自然生成的媽祖石像上尿尿，結果腳不良於行，於是孩童父母趕緊到石像前謝罪，爾後有位善心人士便因此蓋了一座草房廟供奉石媽祖，並發願等賺錢發達後再好好改建，果真不多久該善心人士發達了便重新修建宮廟，並請專人替石媽祖開面，於是水南宮(鎮南宮前身名)正式誕生。

宮內最大的特色，是主神石媽祖連著神桌和左右二根石柱，都是同一座石頭公，長約一０五公尺而且形狀成鶴狀，鄉民稱它為白鶴仙師。

深坑鎮南宮旁有一登山石階步道，約有384階，路旁有設置「石媽祖路碑」的紀錄及建築步道的歷史說明碑。步道蜿蜒在青山的綠林中，站在石媽祖廟前的廣場可以俯瞰深坑區的全景。